感染科的重點項目有兩個，一個是病人的照顧，一個是院內感染管制。感染科的病人包羅萬象，主要是感染症與傳染病。感染症致病原通常來自於病人本身 (self infection)，又稱內源性感染 (endogenous infection) ，傳染病是一種可以從一個人或其他物種，經過各種途徑傳染給另一個人或物種的感染病。常見感染症，如感冒、肺炎、尿道炎、蜂窩組織炎、肝膿瘍、腦膜炎、心臟內膜炎、骨隨炎，也包含一些不常見之感染症，如免疫力地下宿主感染、不明熱、傷口感染等等。導致免疫力低下的原因有腫瘤、化療、免疫抑制劑、與愛滋病等。常見傳染病有登革熱、立克次體感染症、疥蟲、流行性感冒、腸病毒、水痘、結核病、性病等，其他少見傳染病有中東呼吸症候群冠狀病毒、茲卡病毒、伊波拉病毒感染等。這些病人有些只需門診治療，有些需要住院照顧。

抗生素在疾病的治療上，占有非常重要之角色，不適當的抗生素不僅無法有效治療病人，甚至可能產生併發症，而抗生素的濫用衍生抗藥性細菌的感染，會導致病人無藥可用，合理的使用抗生素可以讓病人得到適當的治療、避免抗藥性的氾濫、降低藥費支出。試想一位得到痰抹片陽性(開放性)肺結核病人，沒有遵守感染管制的建議，如戴口罩、入住負壓隔離病室、院內到處亂跑，把肺結核傳染給其他病人，導致被感染者的數量一發不可收拾，醫護同仁無力負擔的悲劇，所以院內感染管制很重要，舉凡洗手、動線、監測環境、統計醫療照護相關感染密度等等都是院內感染管制的一環，院內感控的目的在於確保病人、醫院員工、環境的安全。